北京通州区 农村宅基地上面的平房遗产继承问题

母亲过世前，将宅基地上的五间平房通过法院做了分割。自己一间，女儿，儿子各两间。法院判决书是这样的描述。后听从建议，儿子，女儿分别从自己的份额里面拿出一间给了母亲，这是通过协议来操作的。 现在母亲不在了，她曾经交代，她名下的房子，车子都是儿子的。女儿没有意见。 想问一下，这种情况是否需要走法院程序？还是直接公证？不明白的地方是，房子是农村宅基地，不是商品房。没有房本，只有村委会当年建造房屋时的批条。还有，儿女是商业户口，母亲是农业户口。再就是，后来签的协议是否有法律效力？儿子女儿经过协商后，认为还是每人拥有两间，母亲那一间是公认的遗产。 车子有全部手续。