集体土地使用权互换后土地证已变更，但对互换协议有争议怎么办

A，B两家互为前后邻居，A家在前，B家在后，94年A家重建房子，同B家签定了一份集体土地互换的协议，由村和镇政府出面公证，并完成了土地证的变更。土地证上没有具体的尺寸标注。 协议主要内容为A家造新房时往南前移4公尺，空出来的屋后南北长3.22公尺，东西长32.7公尺的这块地跟B的另外一块地互换。这样的话，A房子后面还有4-3.22=0.78公尺可以做为荫架地，但协议上却写了A只有0.6公尺的荫架地，数据间互相矛盾。 因A，B家之间原有一条1.8公尺的小路，互换后B家把换得的3.22宽地块跟路面一起调整了打了围墙，在围墙的外面南边又剩出了一条小路紧挨A的房子，村里浇水泥路的时候又把路面浇宽了，现在A家屋后只剩下不到0.3公尺的荫架地。 因A家平时只有两位留守老人，所以浇路时未主张自己的权利，现子女回来需对房子修里，对上诉2点问题不知该走什么程序，或者可否主张权利？