土地证面积与实际房屋面积不符怎么办

我家老房子旧的房产证上原本是有正屋和庭院的面积，可是在重建时办理的国土证上只显示了正屋的建筑面积，却没有显示庭院面积，因当时没有注意到这一点，等过了几年后，现在我们要办房产证了，才发现我们家的庭院面积不能办理到房产证上。 请问：我该怎么办，才能将我们家的庭院面积办理到新房产证上去？