我父亲为医院退休医生非农村户口，母亲无工作随父亲迁户口非农村户口，祖父在我父亲还为结婚前已经过世多年我如果我父亲和A额外 ….

我父亲为医院退休医生非农村户口，母亲无工作随父亲迁户口非农村户口，祖父在我父亲还为结婚前已经过世多年，祖母于2013年也过世，老人过世的时候遗留有宅基地一宗，上面有泥瓦房一栋建筑面积为152平方米，没有办理有房产证。我父亲兄妹共四人，大哥因结婚时候为上门女婿另建房，放弃对此处房屋使用权，大姐已经出嫁在外村也放弃对此房屋使用权。。祖母还在世的时候因父亲在县城工作，祖母随A在农村生活，我父亲与A协商是老人随A生活，父亲负责赡养，2007年A没有告知家人自行到村里办理了宅基地集体土地所有证，证件是显示使用权人为A个人。后祖母过世后将其遗留的现金平分，大伯及姑妈因另有住处放弃对房屋使用权，协商由我父亲及与A共同平分此处房屋。A及其配偶子女无异议。现我父亲和A分别出资35万，28万在平分的旧房上修建了新的混凝土楼房，待分户时候A拿出集体土地所有证让我们去办理相关分户手续，但是因目前政策限制，我父亲无法办理分户确权，请问在这样的情况下，我父亲所独自出资的房屋是否还有保障，我如果我父亲和A额外签订分房协议是否有法律效力？