导致平均单价超出国家规定，不适应购房合同条例。不适用本条约定）如果开发商不同意补偿款

您好!我于2009年10月份买了一套房，当年10月份已交契税，今年12月份要出房产证时，律师打电话来说要另外补税，交到3%的税，之前交的是1。5%的税，说是套内大面积实测面积少了，导致平均单价超出国家规定，所以要补税，但是少了面积，开发商不予补款，说是按套出售，不适应购房合同条例。现在是我的房子面积变小了而又要补税，我觉得作为业主这样对于我有失公平.合同中，第四条：计价方式与价款，2、该商品房属预售商品房，按套出售并计价。第五条：面积确认及面积差异处理。（当事人选择按第四条第二种方式计价的，不适用本条约定）。当时签的时候都没有很明显看到这一条，也不明白这些。现在出现这种情况，我的权益是不是就不能维护了。我能要求开发商补偿少了面积部分的房款吗?契税部分我应该要去补交吗?如果开发商不同意补偿款,我要求开发商补交契税能得到支持吗?